Молекулярная структура и колебательные спектры 4-(4-гидроксифенилазо)фталонитрила: DFT изучение
Аннотация
С помощью квантово-химических расчетов (метод теории функционала плотности, функционал B3LYP) и проведенных QTAIM (квантовая теория атомов в молекуле), NPA (анализ заселенности натуральных атомных орбиталей), NBO (натуральные орбитали связей), NCI (анализ нековалентных взаимодействий) анализов изучены особенности строения, конформационного многообразия и изомерных форм 4-(4-гидроксифенилазо)фталонитрила (p-HPhAPN). Выполнен анализ влияния гидроксильной и нитрильных групп на геометрическое строение молекулы в сравнении с исходным азобензолом (Ab) и изомерами, отличающимися расположением гидроксильной группы, - m-HPhAPN, o-HPhAPN. На примере рассмотренных фталонитрилов выполнен анализ чувствительности метода газовой электронографии (ГЭ) к структурным изменениям, обусловленным различными расположениями атомов водорода гидроксильной группы и самой гидроксильной группы, цисоидным/трансоидным расположением нитрильных групп по отношению к азогруппе, таутомерией и цис-транс-изомерией. Для этого сопоставлены теоретические функции радиального распределения f(r) возможных структур p-HPhAPN и его изомеров m-HPhAPN, o-HPhAPN. На основании ГЭ экспериментальных данных возможно различить структуры таутомеров, а также цис- и транс-изомеров, в связи со значительными различиями межъядерных расстояний между химически связанными и не связанными атомами. Цисоидное/трансоидное расположения циано-групп по отношению к мостику -N=N- сказываются лишь на дальних расстояниях. Проведено описание колебаний p-HPhAPN на основе анализа распределения потенциальной энергии (РПЭ) форм нормальных колебаний по естественным колебательным координатам. РПЭ большинства нормальных колебаний по внутренним координатам для p-HPhAPN, как и для Ab, имеет сложный характер. Выполнен анализ влияния геометрического строения рассмотренных структур на характеристики ИК-спектров.
Литература
Fedele C., Ruoko T.-P., Kuntze K., Virkki M., Priimagi A. Photochem. Photobiol. Sci. 2022, 21, 1719-1734. https://doi.org/10.1007/s43630-022-00262-8
Giles L.W., Faul C.F.J., Tabor R.F. Mater. Adv. 2021, 2, 4152-4164. https://doi.org/10.1039/D1MA00340B
Purkait M.K., Sinha M.K., Mondal P., Singh R. Photoresponsive Membranes. In: Interface Science and Technology, Vol. 25 (Purkait M.K., Sinha M.K., Mondal P., Singh R., Eds.), Elsevier, 2018, Ch. 4, 115-144. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-813961-5.00004-8
Natansohn A., Rochon P. Chem. Rev. 2002, 102, 4139-4176. https://doi.org/10.1021/cr970155y
Manickasundaram S., Kannan P., Hassan Q.M.A., Palanisamy P.K. J. Mater. Sci. Mater. Electron. 2008, 19, 1045-1053. https://doi.org/10.1007/s10854-007-9450-y
Beharry A.A., Woolley G.A. Chem. Soc. Rev. 2011, 40, 4422-4437. https://doi.org/10.1039/c1cs15023e
Mohr G.J., Müller H., Bussemer B., Stark A., Carofiglio T., Trupp S., Heuermann R., Henkel T., Escudero D., González L. Anal. Bioanal. Chem. 2008, 392, 1411-1418. https://doi.org/10.1007/s00216-008-2428-7
Shikhaliyev N.Q., Kuznetsov M.L., Maharramov A.M., Gurbanov A.V., Ahmadova N.E., Nenajdenko V.G., Mahmudov K.T., Pombeiro A.J.L. CrystEngComm 2019, 21, 5032-5038. https://doi.org/10.1039/C9CE00956F
Tikhomirova T.V., Znoiko S.A., Shaposhnikov G.P. Russ. J. Gen. Chem. 2018, 88, 1164-1171. https://doi.org/10.1134/S1070363218060191
Bouwstra J.A., Schouten A., Kroon J. Acta Crystallogr.: Sect. C 1983, 39, 1121-1123. https://doi.org/10.1107/S0108270183007611
Brown C.J. Acta Crystallogr. 1966, 21, 146-152. https://doi.org/10.1107/S0365110X66002445
Harada J., Ogawa K., Tomoda S. Acta Crystallogr.: Sect. B 1997, 53, 662-672. https://doi.org/10.1107/S0108768197002772
Ramesh Babu R., Kumaresan S., Vijayan N., Gunasekaran M., Gopalakrishnan R., Kannan P., Ramasamy P. J. Cryst. Growth 2003, 256, 387-392. https://doi.org/10.1016/S0022-0248(03)01369-1
Zhang C.Z. Acta Crystallogr.: Sect. E. Struct. Rep. Online 2008, 64, o618. https://doi.org/10.1107/S1600536808004716
Bushuyev O.S., Friščić T., Barrett C.J. Cryst. Growth Des. 2016, 16, 541-545. https://doi.org/10.1021/acs.cgd.5b01361
Harada J., Ogawa K. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3539-3544. https://doi.org/10.1021/ja038203l
Traetteberg M., Hillmo I., Hagen K. J. Mol. Struct. 1977, 39, 231-239. https://doi.org/10.1016/0022-2860(77)85093-X
Tsuji T., Takashima H., Takeuchi H., Egawa T., Konaka S. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 9347-9353. https://doi.org/10.1021/jp004418v
Mahmood A., Khan S.U.-D., Rana U.A. J. Comput. Electron. 2014, 13, 1033-1041. https://doi.org/10.1007/s10825-014-0628-2
Mahmood A., Tahir M.H., Irfan A., Al-Sehemi A.G., Al-Assiri M.S. Comput. Theor. Chem. 2015, 1066, 94-99. https://doi.org/10.1016/j.comptc.2015.05.020
Gaussian 09, Revision D.01. Frisch M.J., Trucks G.W., Schlegel H.B., Scuseria G.E., Robb M.A., Cheeseman J.R., Scalmani G., Barone V., Mennucci B., Petersson G.A., Nakatsuji H., Caricato M., Li X., Hratchian H.P., Izmaylov A.F., Bloino J., Zheng G., Sonnenberg J.L., Hada M., Ehara M., Toyota K., Fukuda R., Hasegawa J., Ishida M., Nakajima T., Honda Y., Kitao O., Nakai H., Vreven T., Montgomery J.A. Jr., Peralta J.E., Ogliaro F., Bearpark M., Heyd J.J., Brothers E., Kudin K.N., Staroverov V.N., Kobayashi R., Normand J., Raghavachari K., Rendell A., Burant J.C., Iyengar S.S., Tomasi J., Cossi M., Rega N., Millam J.M., Klene M., Knox J.E., Cross J.B., Bakken V., Adamo C., Jaramillo J., Gomperts R., Stratmann R.E., Yazyev O., Austin A.J., Cammi R., Pomelli C., Ochterski J.W., Martin R.L., Morokuma K., Zakrzewski V.G., Voth G.A., Salvador P., Dannenberg J.J., Dapprich S., Daniels A.D., Farkas O., Foresman J.B., Ortiz J.V., Cioslowski J., Fox D.J., Gaussian, Inc., Wallingford CT, 2009.
Ditchfield R., Hehre W.J., Pople J.A. J. Chem. Phys. 1971, 54, 724-728. https://doi.org/10.1063/1.1674902
Hehre W.J., Ditchfield K., Pople J.A. J. Chem. Phys. 1972, 56, 2257-2261. https://doi.org/10.1063/1.1677527
Hariharan P.C., Pople J.A. Theor. Chim. Acta 1973, 28, 213-222. https://doi.org/10.1007/BF00533485
Clark T., Chandrasekhar J., Spitznagel G.W., Schleyer P.V.R. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294-301. https://doi.org/10.1002/jcc.540040303
Feller D. J. Comput. Chem. 1996, 17, 1571-1586. https://doi.org/10.1002/(SICI)1096-987X(199610)17:13<1571::AID-JCC9>3.0.CO;2-P
Schuchardt K.L., Didier B.T., Elsethagen T., Sun L., Gurumoorthi V., Chase J., Li J., Windus T.L. J. Chem. Inf. Model. 2007, 47, 1045-1052. https://doi.org/10.1021/ci600510j
Pritchard B.P., Altarawy D., Didier B., Gibson T.D., Windus T.L. J. Chem. Inf. Model. 2019, 59, 4814-4820. https://doi.org/10.1021/acs.jcim.9b00725
Glendening E.D., Badenhoop J.K., Reed A.E., Carpenter J.E., Bohmann J.A., Morales C.M., Weinhold F. NBO Version 5.0, Theoretical Chemistry Institute, University of Wisconsin, Madison, WI, 2001.
Keith T.A. AIMAll (Version 19.10.12), TK Gristmill Software, Overland Park KS, USA, 2019 (aim.tkgristmill.com).
Bushmarinov I.S., Lyssenko K.A., Antipin M.Y. Russ. Chem. Rev. 2009, 78, 283-302. https://doi.org/10.1070/RC2009v078n04ABEH004017
Jeziorski B., Moszynski R., Szalewicz K. Chem. Rev. 1994, 94, 1887-1930. https://doi.org/10.1021/cr00031a008
Parrish R.M., Parker T.M., Sherrill C.D. J. Chem. Theory Comput. 2014, 10, 4417-4431. https://doi.org/10.1021/ct500724p
Parrish R.M., Gonthier J.F., Corminbœuf C., Sherrill C.D. J. Chem. Phys. 2015, 143, 051103. https://doi.org/10.1063/1.4927575
Johnson E.R., Keinan S., Mori-Sánchez P., Contreras-García J., Cohen A.J., Yang W. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 6498-6506. https://doi.org/10.1021/ja100936w
Lu T., Chen F. J. Comput. Chem. 2012, 33, 580-592. https://doi.org/10.1002/jcc.22885
Smith D.G.A., Burns L.A., Simmonett A.C., Parrish R.M., Schieber M.C., Galvelis R., Kraus P., Kruse H., Di Remigio R., Alenaizan A., James A.M., Lehtola S., Misiewicz J.P., Scheurer M., Shaw R.A., Schriber J.B., Xie Y., Glick Z.L., Sirianni D.A., O'Brien J.S., Waldrop J.M., Kumar A., Hohenstein E.G., Pritchard B.P., Brooks B.R., Schaefer H.F., Sokolov A.Y., Patkowski K., DePrince A.E., Bozkaya U., King R.A., Evangelista F.A., Turney J.M., Crawford T.D., Sherrill C.D. J. Chem. Phys. 2020, 152, 184108. https://doi.org/10.1063/5.0006002
Vishnevskiy Y.V., Zhabanov Y.A. J. Phys. Conf. Ser. 2015, 633, 012076. https://doi.org/10.1088/1742-6596/633/1/012076
Varsányi G. Vibrational Spectra of Benzene Derivatives, Academic Press, New York and London, 1969. https://doi.org/10.1016/B978-0-12-714950-9.50007-7
Varsányi G., Láng L. Assignments for Vibrational Spectra of Seven Hundred Benzene Derivatives, Wiley, 1974.
Gardner A.M., Wright T.G. J. Chem. Phys. 2011, 135, 114305. https://doi.org/10.1063/1.3638266
Stepanić V., Baranović G., Smrečki V. J. Mol. Struct. 2001, 569, 89-109. https://doi.org/10.1016/S0022-2860(00)00967-4
Gagliardi L., Orlandi G., Bernardi F., Cembran A., Garavelli M. Theor. Chem. Acc. 2004, 111, 363-372. https://doi.org/10.1007/s00214-003-0528-1
Duarte L., Fausto R., Reva I. Phys. Chem. Chem. Phys. 2014, 16, 16919-16930. https://doi.org/10.1039/C4CP00240G
Armstrong D.R., Clarkson J., Smith W.E. J. Phys. Chem. 1995, 99, 17825-17831. https://doi.org/10.1021/j100051a005
Katon J.E., Lippincott E.R. Spectrochim. Acta 1959, 15, 627-650. https://doi.org/10.1016/S0371-1951(59)80360-X
Zhurko G.A. Chemcraft - graphical software for visualization of quantum chemistry computations (https://www.chemcraftprog.com, accessed Sept. 21, 2021).
Tikhomirova T.V., Gruzdeva O.M., Shaposhnikov G.P. Russ. J. Gen. Chem. 2015, 85, 2778-2785. https://doi.org/10.1134/S1070363215120208
Fliegl H., Köhn A., Hättig C., Ahlrichs R. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9821-9827. https://doi.org/10.1021/ja034433o
Hättig C., Hald K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 2111-2118. https://doi.org/10.1039/b110847f
Briquet L., Vercauteren D.P., Perpète E.A., Jacquemin D. Chem. Phys. Lett. 2006, 417, 190-195. https://doi.org/10.1016/j.cplett.2005.09.119
Chen P.C., Chieh Y.C. J. Mol. Struct. THEOCHEM 2003, 624, 191-200. https://doi.org/10.1016/S0166-1280(02)00783-2
Giricheva N.I., Lebedev I.S., Fedorov M.S., Bubnova K.E., Girichev G.V. J. Struct. Chem. 2021, 62, 1976-1987. https://doi.org/10.1134/S0022476621120179
Tait K.M., Parkinson J.A., Gibson D.I., Richardson P.R., Ebenezer W.J., Hutchings M.G., Jones A.C. Photochem. Photobiol. Sci. 2007, 6, 1010-1018. https://doi.org/10.1039/b703044d
Girichev G.V., Tverdova N.V., Giricheva N.I., Savelyev D.S., Ol'shevskaya V.A., Ageeva T.A., Zaitsev A.V., Koifman O.I. J. Mol. Struct. 2019, 1183, 137-148. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2019.01.055
Kurochkin I.Y., Pogonin A.E., Otlyotov A.A., Kiselev A.N., Krasnov A.V., Shlykov S.A., Girichev G.V. J. Mol. Struct. 2020, 1221, 128662. https://doi.org/10.1016/j.molstruc.2020.128662